A educação profissional é uma das linhas de atuação da ISCAL. Um trabalho voltado para a qualificação dos futuros profissionais da área de saúde que é desenvolvido pelo Centro de Educação Profissional Mater Ter Admirabilis (CEP MTA).
Os cursos principais são o de Auxiliar de Enfermagem e o de Técnico em Enfermagem. Outros vários cursos também são oferecidos pelo Centro de Educação – técnicos, atualizações, especializações técnicas – todos em saúde.